Описание:

Секвенатор Oxford Nanopore PromethION представляет собой автономное высокопроизводительное устройство, позволяющее проводить длинные прочтения в режиме реального времени - технология прямого секвенирования больших фрагментов ДНК и РНК. В настоящее время устройства PromethION доступны по программе раннего доступа (PromethION Early Access Programme, PEAP).

Секвенатор может работать со многими ячейками (до 48) в любое время. Устройство позволяет производить секвенирование по заказу. Пользователи могут запускать и останавливать проведение отдельных исследований по мере необходимости, а также задействовать большое число ячеек при их проведении для увеличения скорости и производительности. 

Встроенное вычислительное устройство позволяет производить распознавание азотистых оснований и дальнейший анализ в режиме реального времени.

Каждая из 48-ми ячеек может одновременно проводить секвенирование на 3 000 нанопор, что потенциально позволяет получить до 12 Тб данных с одного устройства (ср. с 512 нанопорами на одну проточную ячейку MinION).

 

Применяемость

• оказание услуг по секвенированию;
• реализация проектов, требующих получения чрезвычайно больших объемов данных (Тб);
• секвенирование по заказу большого количества образцов;

Особенности:

• Длинные прочтения:
  • выбор длины считываемого фрагмента: от нескольких до сотен кб;
  • простота сборки и фазирование;
  • работа с повторяющимися участками;
• Работа в режиме реального времени:
  • мгновенный доступ к данным;
  • быстрый анализ данных;
  • быстрое получение информации о качестве образца;
• Быстрая и простая подготовка:
  • например, подготовка библиотеки протокола 1D составляет менее 10 мин;
  • низкая стоимость материалов;
  • подготовка не требует квалифицированных специалистов;
• Опции по заказу:
  • возможность использования произвольного числа ячеек из 48;
  • штрих-код для исследования большого количества образцов;
  • возможность проведения многих исследований на одном устройстве;
• Доступность:
  • не требует капитальных затрат;
  • простота установки;
  • не нуждается в дополнительном лабораторном оборудовании или оснастке.

 

Технические характеристики:

• высокопроизводительная настольная система для секвенирования большого числа образцов;
• модульная конструкция: 48 проточных ячеек по 3 000 нанопор (всего 144 000); устройство позволяет использовать многолуночные планшеты/плашки и различные технологии при проведении множественных исследований без ограничения времени прогона; 
• возможность раздельного или одновременного запуска ячеек (параллельное секвенирование).

 

Технические характеристики различных версий PromethION (согласно плану выпуска):

Модель	Alpha System	Beta System  (текущая версия) Ранее «Alpha-Beta System»	MKI System
Изображение
Поток данных на ячейку	>50 Гб	≥ 150 Гб	Планируется увеличить скорость кол-во нанопор и, соответственно, поток данных, ориентировочно, до 250 Гб
Поток данных на устройство	1,2 Тб	3-6 Тб	В зависимости от улучшений, до 20 Тб
Макс. кол-во ячеек	24	24 с возможностью увеличения до 48	48

 

Комплект поставки:

Секвенатор PromethION и вычислительное устройство	Включено
Ячейки PromethION, 60 шт.	Включено
Наборы реагентов для секвенирования, 12 шт.	Включено
Обучение пользователей	Включено
Договор на сервисное обслуживание (на срок эксплуатации 60-ти ячеек, поставляемых в комплекте поставки)	Включено